初有山东人”李三"于此"草创茅屋数间开店"，而得名“李三店”。
中华民国成立后，1913年隶属龙江县管辖。
1916年3月，划入济沁河稽垦局范围。
稽垦局设于李三店，管理荒务。
1926年2月，正式并入新设立的雅鲁设治局管辖。
1929年“改局为县”，隶属雅鲁县管辖。
东北沦陷后，1933年4月，划归龙江县管辖，初设李三店保，1938年4月改设李三店村。
1945年“九三”抗日战争胜利后，1946年6月设置李三店区，1948年改为第五区。
中华人民共和国建立后，1951年9月，设置李三店镇，为区辖镇。
1956年3月，改设乡级镇，改名为龙兴镇。
1957年5月，将东南乡并入龙兴镇。
1958年6月，又将朝阳山、湾龙沟、旧边3乡并入龙兴镇。
同年9月，与新盛乡合并，成立龙兴人民公社。
1984年4月，改为龙兴镇，名称沿用至今。