原属汤原县管辖。
1939年6月划归鹤立县管辖,隶属兴山街。
1945年“九三”抗日战争胜利后,1946年设立南山区,隶属兴山市管辖。
1948年撤销南山区。
1949年11月,改隶鹤岗市。
1954年设立南山街道。
1958年11月改称南山经济区。
1960年12月10日,省人民委员会批准,正式设立南山区。
1966年8月31日,鹤岗市人民委员会批准,改称东风区。
1980年4月24日,省人民政府批准,将东风、跃进(1958年设大陆经济区,1960年12月正式设立大陆区。
1966年8月31日,改称跃进区。
)两区合并为南山区,名称沿用至今。