清代晚期形成聚落，1914年设碾子山火车站。
隶属龙江县第二区管辖。
东北沦陷后，始设碾子山保，后改设碾子山村。
1945年，“九三”抗日战争胜利后，始设碾子山区，后改为第四区。
1952年10月，设置碾子山镇。
1958年9月，将碾子山镇改称超美人民公社。
同年12月，以华安机械厂为主体“厂社合并”，成立华安人民公社，由嫩江专员公署领导。
1959年，将甘南县中兴公社的三皇庙、簸箕山、马架屯划归华安公社管辖。
1960年5月，划归齐齐哈尔市管辖。
1960年12月，将华安公社改为华安区。
1961年8月，成立华安公社农村分社，9月政企分。
1980年6月将跃进街道所辖农村划出，增设曙光人民公社。
1983年12月，将华安区改为碾子山区，名称沿用至今。