清乾隆元年（1736），设立乌兰诺尔站（今肇源县新站）至呼兰城驿路，在额设6台中依次排为第一台，故名“头台”。
中华民国时期，郭尔罗斯后旗设头台乡。
东北沦陷后，初设头台保，后改设头台村。
1945年“九三”抗日战争胜利后，1946年设置头台区，1949年改为第五区。
1956年3月，设置头台乡。
同年4月，改隶肇源县。
1958年9月，改称头台人民公社。
1984年3月，改为头台乡。
1985年5月，改设头台镇。