西周属卫。
春秋置蒲邑（今长垣县城）、匡邑（今恼里）。
战国属魏，并匡、蒲置首垣邑（遗址在今满村镇陈墙一带）。
秦始皇二十六年（前221）改首垣邑为长垣县，属三川郡。
西汉天汉三年（前98）至初始元年（8），境内置有长罗侯国（今樊相一带）。
新莽始建国元年（9）至地皇四年（23）更长垣县名为长固县，属兖州陈留郡。
更始元年（23）复名长垣县。
东汉建武元年（25）析置长垣侯国。
三国属魏。
西晋泰始元年（265）属陈留国。
隋开皇十六年（596）移县治于妇姑城（今南蒲街道司坡一带），以治南有古匡城改名匡城县，属东郡。
五代后梁开平元年（907）为避太祖朱温父名讳，复长垣县，属汴州。
后唐同兴元年（924）仍名匡城县。
宋建隆元年（960）避太祖匡字讳，改为鹤丘县，属京畿路开封府。
大中祥符元年（1008）废鹤丘，仍名长垣。
金泰和四年（1204）县治迁鲍堌村（今苗寨镇旧城一带），改属大名路开州。
元太祖二十二年（1228）改县名为保垣州，地域东扩。
数年后，仍名长垣县，东扩地域归县。
明洪武二年（1369）避水患，县治移古蒲城，即今址。
清天命元年（1616）属直隶省大名府。
1912年属直隶省大名道。
1936年属河北省第十一行政督察区。
1949年属平原省濮阳专区。
1952年归河南省濮阳专区。
1954年改属新乡专区。
1955年属安阳专区。
1958年改属新乡专区。
1961年复属安阳专区。
1969年属安阳地区。
1983年属濮阳市。
1986年属新乡市。
2019年撤销长垣县，设立长垣市（县级）。