1948年属大隗区管辖。
1957年撤销大隗区并乡，建立苟堂、河西、玉皇庙3个小乡。
1958年撤3个小乡合并为苟堂乡，属苟堂乡。
1958年6月属苟堂金星人民公社。
1958年11月属大隗人民公社。
1961年，成立玉皇庙大队，隶属大隗管辖。
1963年成立苟堂人民公社，玉皇庙大队属于苟堂人民公社。
1983年撤销玉皇庙大队选举产生玉皇庙村民委员会，属苟堂公社。
同年苟堂人民公社改为苟堂乡后，玉皇庙村民委员会属苟堂乡。
1997年乡镇行政区划调整将苟堂乡撤乡建镇后，玉皇庙村民委员会属苟堂镇，沿用至今。