李店全称李家店，因李家店集镇而得名。
1949年10月，安陆县辖10区，李店隶属于长兴区。
1952年10月，安陆县辖7区1镇，134个乡。
李店隶属于第一区22乡里面的紫石乡。
1954年8月区乡调整，安陆县辖6区1镇88乡，李店区辖13乡。
1956年3月区、乡再次调整，全乡并为35乡，李店隶属第二区。
1958年9月建立人民公社，李店属于上游人民公社。
1966年9月，各区更换名称，李店改为东风，1975年2月，撤区并社，李店隶属于李店人民公社。
1984年1月复置区（镇）李家店区公所住李家店镇，辖4个管理区27个行政村1个街道。
2010年1月，将原十里管理区所辖十里、红石、卓湾、新河、楚跃社区并入市经洛开发区。
至此，李店镇行政区划由原来的27个行政村1个社区变成23个行政村1个社区。