该镇清代属宣化乡；民国时期先后属梅桥联堡和金梅乡、石洪乡、湖沼乡；解放初分属保安区和长灵区。
1955年9月8日成立金山店办事处；1960年4月成立金山店镇，属黄石市管辖，同年8月，金山店镇改称金山店城市人民公社，1961年9月更名为金山店镇；1975年11月撤区并社，由矿山区划出车桥，保安区划出梅山、土桥，3个小公社合并成金山店人民公社；1984年3月，改革政社合一领导体制，实行政社分设，将金山店人民公社改为金山店乡，同年12月11日，金山店乡与金山店镇合并成新的金山店镇，沿用至今。