明朝至清朝前期，狮子口镇东南部为公安县永安乡谷升村部分，西北部为长乐乡刀环村、白湖村、牛头村部分。
清朝后期，镇东南部为长乐乡谷升里部分，西北部为永安乡刀环里、白湖里、牛头里部分。
民国时期，镇东部属公安县一区、二区，西部属二、三区。
1948年镇东部属保和乡，西部属靖和乡。
1950年镇东部属城关区（现南平镇），西部属申津渡区（原申津渡镇）。
1951年设金狮乡，1955年镇东部属金狮区（现南平镇），西部属东港（现斑竹垱镇）。
1956年撤区并乡，镇东部属金顺乡（狮子口）、保城乡（王家场），西部属群兴乡（申津渡）、大湖乡（河口）。
1958年为金狮人民公社（狮子口）。
1961年恢复区建制，金狮人民公社改为金狮区，下辖管理区改为公社。
1975年撤区并社，镇东部设金狮公社（狮子口）、西部设群兴公社（申津渡）。
1978年，群兴公社并入金狮公社（狮子口）。
1983年恢复区建制，金狮人民公社改为金狮区（狮子口），设狮子口镇。
1987年撤区并镇，镇东部设狮子口镇（狮子口），西部设申津渡镇（申津渡）。
1999年12月，申津渡镇并入狮子口镇，地名沿用至今。