明嘉靖年间属惠化乡；清康熙年间属从义乡；民国时期属仁寿乡；1949年属陈巷区；1955年为吴氏祠社，属陈巷区南街乡；1958年成立人民公社，为吴氏祠大队，属红旗公社陈巷管理区；1959年为吴氏祠大队，属陈巷公社陈巷管理区；1961年恢复区（镇）建制，为吴氏祠大队，属陈巷区陈巷公社；1975年撤区并社，更名为东方红大队，属陈巷公社；1980年改为吴氏祠大队，属陈巷公社陈巷管理区；1983年底设区建乡，为吴氏祠村，属陈巷区陈巷乡；1987年撤区并乡，为吴氏祠村，属陈巷镇至今。
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