明嘉靖年间属仁义乡；清康熙年间属遵义乡；民国时期属吴溪乡；1949年5月属吴店区；1955年为浆东社，属吴店区浆溪店乡；1958年成立人民公社，为4大队，属上游公社浆溪店管理区；1959年为4大队，属郝店公社浆溪店管理区；1961年4月恢复区（镇）建制，为4大队，属郝店区浆溪店公社；1974年更名为土门大队，属郝店区浆溪店公社；1975年2月撤区并社，为土门大队，属吴店公社；1980年更名为三土门大队，属吴店公社浆溪店管理区。
1983年底设区建乡，为三土门村，属吴店区浆溪店乡；1987年撤区并乡，为三土门村，属浆溪店乡；1990年10月撤浆溪店乡并入吴店镇，为三土门村，属吴店镇至今。