唐虞三代，地属扬州。
东周、春秋前期属楚。
后属吴。
汉文帝十六年（前164），境内始设立寻阳县（县治在如今黄梅县蔡山镇附近）。
西晋永兴元年（304）划庐江的寻阳，武昌的柴桑设寻阳郡。
又划以（今）太白湖、龙感湖一线江北故道为界，北境属蕲春县辖，南境归江南寻阳县。
东晋太元三年（378），改蕲春县为蕲阳县。
南齐永明四年（486），划蕲阳县东境辖地设置永兴县。
隋开皇初（581），改永兴县为新蔡县，隋开皇十八年（598）改新蔡县为黄梅县。
唐武德四年（621），将黄梅县划分为义丰、长吉、塘阳、新蔡四个县，设南晋州辖。
唐武德八年（625）撤南晋州，又改为黄梅县属蕲州辖。
宋至道三年（997）分全国为十五路，属淮南路蕲州蕲春郡辖。
元至元二十三年（1286），属蕲州，隶属湖广行省。
皇庆元年（1312），迁县治于今黄梅镇，隶湖广行中书省蕲州府。
明代改设司、府、州、县制，属湖广布政司黄州府辖。
清沿明制，仍属黄州府辖。
民国初，废除黄州府，改属江汉道辖。
后江汉道废除，改属湖北省第三行政督察区辖。
民国二十五年（1936），界定湖北、江西两省省界时，国民政府行政院将长江以北九江县属封廓洲、团牌洲等地，划归湖北省黄梅县辖。
民国二十九年（1940），改行政督察区为鄂东行省，黄梅隶之。
1949年属黄冈地区辖。
1995年12月23日，《国务院关于同意湖北省撤销黄冈地区设立地级黄冈市的批复》国函〔1995〕130号，撤销黄冈地区和黄州市，设立地级黄冈市，黄梅县隶属黄冈市领导，沿用至今。