古属蛮夷国，周初（公元前841年）为巴子国地，后为夔子国地，战国时（公元前475）属楚巫郡地，秦（公元前221）属黔中郡，西汉高祖元年（公元前206）属武陵郡，东汉建武元年（公元25年）并属南郡，三国两晋魏文帝黄初元年（220）至晋武帝太康二年（281）属建平郡，南朝宋武帝永初元年（420）、齐、梁属宜都郡，北周属乌飞县，隋文帝开皇十年（590）属清化郡开夷县，唐高祖武德元年（618）至乾宁二年（895）属黔中道清江县，五代后梁开平元年（907）为羁縻感化州，宋初太祖建隆元年（960）属富州地，中属柔远州，初名懿州，后改为安定州。
元世祖至元十六年（1279）属土司分治，属金峒安抚司，明太祖洪武元年（1368）、明万历十年（1582）属施州卫，清顺治元年（1644）属金峒安抚司、清雍正十三年（1735）改土归流置咸丰县名。
清道光十七年（1837），全县编户8里，小村属礼忠里，礼忠里辖小村、大村、李子溪，中心场、燕子嵌。
民国初年（1912年），因军阀混战，地方乡坤，练团保境，设团防局，全县共设36团，县设保卫团总公所。
小村乡境内设大村、小村、李子溪三个团防局，小村村属小村团防局（31团）。
1933年（民国二十二年），废团防局，成立4个区，小村属第三区，区公所设清水塘，下设保、甲，第三区共58保，580甲，设保董和保长，保辖区范围与今村委会大致相同。
甲设甲长，范围与人口和现今的村民小组大致相当。
1941年（民国三十年）9月，咸丰县撤一（丁寨）二（尖山寺）两区，保留清水塘区署，同时将19个联保199保1808甲划成15个乡镇，小村村属三合乡，三合乡辖大村、小村、李子溪、中心场，乡公所设在小村。
新中国成立后，1950年按行政区域划分隶属第五区的三合乡，乡政府驻地钟塘，1958年10月，全县划分为11个人民公社，小村为红光公社，公社管委会驻地小村，11月以地名称将红光公社更名为小村公社，管委会驻地小村。
小村公社下辖小村、大村、中心场、李子溪四个管理区小村村属小村管理区。
1961年6月全县撤消8个大公社，设立区，小村区下辖小村、大村、中心场、李子溪4个人民公社以及生产大队和生产队。
小村村属小村公社，1975年撤小村区更名为小村公社，1981年全国第一次地名普查进行标准化处理时，定名为先锋生产大队，1984年撤销小村公社恢复为小村区公所，先锋大队更名为小村村，属小村镇。
1996年属小村乡，2002年将土地村和小村村村合并为小村村，2008年行政区划又将小村村和土地溪村分开，沿用至今。