清光绪十五年（1889）称木石港，属昌平乡；1935年第五区；1949年6月为第三区，驻木石港。
1951年2月撤销原第三区，分设六、七区，为第七区公所。
1951年10月，第七区又分设为第十、十一两区，为第十区公所。
1954年12月，改为第六区公所。
1958年11月改为东方红人民公社，1959年1月为木港人民公社管理委员会，1961年6月为木港区公所。
1968年1月成立木港区革命委员会，1975年2月改为木港人民公社革命委员会。
1976年为木港人民公社革命委员会，1981年1月为公社管理委员会，1984年2月与东春公社及大德公社的一部分合并，成立木港区公所。
1987年9月撤区成立木港镇，属阳新县至今。
木港镇人民政府驻地位于木石港老街138号。