明朝时期属感化乡；清朝属於菟乡，在清同治年间为人和会；1923年划归云梦第七团防区（魏店），1937年为第二区（义堂）；1945年10月后为明道乡治所；1949年4月后，属第二区（魏店）；1949年8月后，属新二区（魏店）；1955年6月后，属魏店区；1956年2月，云梦县撤区并乡，始设曾店镇，上属云梦县人民委员会，下辖倒店、罗店、曾店、徐店、刘集、福量等6乡；1958年9月，撤销曾店镇，成立英雄人民公社；1959年1月更名为曾店人民公社；1961年4月改设曾店区公所，管辖倒店、魏店、徐店、朱桥、水庙、人和、冯铺等7个人民公社；1968年1月成立曾店区革命委员会；1975年2月曾店区分为曾店人民公社革委会和倒店人民公社革委会；1980年10月，曾店人民公社革委会更名为曾店人民公社管委会；1984年1月，倒店、曾店人民公社管委会合并组建曾店区公所；1987年9月，撤销曾店区公所，再分曾店镇和倒店乡至今。
曾店镇下辖3个管理区（2000年9月撤销），22个村委会，254个村民小组。
2021年8月，调整为曾店社区、肖店社区、石山村、刘店村、朱桥村、大方村、下张村、破黄村、汪冯村、枫梓岗村、刘吴村、新进村、双徐村、长和村、新余村15个村（社区）。
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