五通庙村村民委员会所在地，清代属枝江县第三都、第四都；1913年属枝江县北区；1930年至1936年属第二区署；1940年6月22日属沦陷区伪宜昌县中央治安维持会分会；1941年3月属伪宜昌县政府第五区署；1942年至1945年属江北沦陷区县政府暗组江口区署老周场乡；1946年属新政乡；1949年6月属江口区；1949年7月属枝江县仙女区；1954年2月属枝江县第七区；1955年属宜都县仙女区。
五通庙村前身是1956年成立的永安高级农业社、太平高级农业社，属宜都县仙女指导组石岭乡；1957年11月属仙女区石岭乡；1958年10月更名为永安生产队、太平生产队，属仙女公社石岭管理区；1961年5月改为永安大队、太平大队，属仙女区石岭公社；1962年10月复置枝江县，属枝江县仙女区石岭公社；1975年2月撤区并社，属石岭公社石岭管理区；1981年4月永安大队、太平大队分别更名为五通庙大队、太平桥大队，分属老周场公社桃店管理区、老周场公社周场管理区；1984年1月五通庙大队改为五通庙村，属老周场区桃店乡。
太平桥大队、老周场公社农科站(1975年由太平大队两个生产队组建)分别改名为太平桥村、郭家坪村，属老周场区老周场镇；1987年10月五通庙村、太平桥村、郭家坪村分属老周场乡桃店指导组、老周场乡周场指导组；1991年1月分属老周场乡桃店管理区、老周场乡周场管理区；1994年4月分属仙女镇桃店管理区、仙女镇周场管理区；2001年3月撤销桃店管理区、周场管理区，属仙女镇。
2002年10月五通庙村与太平桥村、郭家坪村合并为五通庙村，属仙女镇至今。