1996年，吉首市辖石家冲街道、红旗门街道、峒河街道、乾州街道、马颈坳镇、河溪镇、矮寨镇、己略乡、万溶江乡、太平乡、丹青乡、双塘乡、白岩乡、吉首乡、社塘坡乡、排吼乡、排绸乡、寨阳乡。
2005年，吉首市撤销吉首乡；将吉首乡3个建制村划入石家冲街道，2个建制村划入红旗门街道，其余16个建制村划入峒河街道；万溶江乡、乾州街道成建制合并设立乾州街道。
2006年，石家冲街道、红旗门街道成建制合并设立镇溪街道。
2017年，新设立石家冲街道。
行政区范围包括石家冲、荣昌坪、营庄、桐油坪4个社区和曙光、栗溪、庄稼、勤丰、寨阳5个建制村，新设立的石家冲街道区域面积52.57平方公里，常住人口约4.3万人。