清雍正六年(1728年),芙蓉镇境域改土归流后属水顺府永顺县。
民国二年(1913年)属永顺县下榔保。
民国十二年(1923年),属下榔乡。
民国二十七年(1938年)属下榔乡。
1949年10月,属水顺县松柏场区。
1952年3月,属第三区太坪乡。
1956年6月,为王村镇。
1958年10月,属高坪人民公社。
1961年,属高坪区王村人民公社。
1983年10月,恢复王村镇(乡级)。
1984年4月,公社改乡制为王村镇。
1986年12月,王村乡并入王村镇。
2007年8月,更名为芙蓉镇。