1840年前后，现北堆村三组海陵河南有一块300多亩的田地，因海拔高出当地近8米多，民众由此称其为“北堆”。
称谓随着历史的变迁并未发生太大的改变，民国时期的北堆村曾属于景东乡，解放后先后成为公兴区、海港乡的一部分。
1957年8月，我国全面开展人民公社化运动兴起，1958年成立北堆大队，1964年后北堆大队公办的土窑使得原有的高出水平面的田地渐渐成为平地，也为北堆村增加了良田面积。
1983年改为北堆村民委员会，简称北堆村委会。