1934年，邹区兴隆桥西为忠善乡，桥东为东唐乡，1947年11月，忠善乡和东唐乡合并为邹区乡。
1949年5月建立邹区乡人民政府。
1956年5月，邹区乡调整为8个行政村，属卜弋人民公社（又称幸福人民公社）。
1958年8月邹区并入卜弋人民公社。
1959年9月，改大社为小社，卜弋与各乡分开，成立邹区人民公社。
1983年5月进行体制改革工作，建立乡政府。
1988年7月，邹区撤乡建镇。
1999年12月，邹区、礼河两镇合并新建邹区镇。
2007年3月，邹区、卜弋两镇再次合并新建邹区镇。
2015年5月区划调整，邹区镇从武进区分出划入钟楼区。
沿用至今。