石脑原属建成县的管辖范围。
唐武德五年（622）建成县改名高安县，石脑属高安县管辖。
1949年前属七区。
1951年5月调整乡的范围，属十一区。
1957年2月，属石脑、连锦乡。
1957年10月至1958年7月，石脑乡与连锦乡合并为石脑乡。
1958年8月，实行人民公社建制，与龙潭乡合并成立卫星公社。
1961年6月，设区划社，属石脑区，成立石脑、溪桥、丁家公社。
1964年4月，撤区扩社并队，将丁家大队、菜田大队、望城大队等划入石脑公社。
1968年5月缩减公社，龙潭公社并入石脑公社，仍属石脑公社。
1972年11月调整公社规模，龙潭公社分出，复名石脑公社。
1984年3月，改公社为乡，改名石脑乡。
1994年8月，撤乡设镇，设立石脑镇至今。