秦始皇二十六年（前221）设庐陵县。
王莽新始建国元年（9），庐陵县改名桓亭县。
东汉建武五年（25），桓亭县复名庐陵县。
东汉初平二年（191），设庐陵郡，庐陵县析置为8个县，吉安县当时称高昌县。
南梁天监元年（502），高昌县并入石阳县。
隋开皇十年（590），石阳县改名庐陵县。
1914年庐陵县改名吉安县。
1926年，吉安县直属江西省。
1949年7月28日，奉令析吉安县石阳镇置吉安市，同属吉安分区。
1958年11月，吉安县并入吉安市，次年6月，县、市仍分治。
1968年，吉安县属井冈山地区。
1979年吉安县属吉安地区；同年11月，县治从吉安市迁至新县城敦厚镇。
1987年兴桥乡、长塘乡、樟山乡划归吉安市；2000年，值夏镇、东固镇、新圩镇、富田乡、文陂乡、云楼乡划归吉安市青原区，曲濑乡划归吉安市吉州区。