清属义宁州上武乡二十三都。
中华人民共和国成立前，三都为吉星乡，西向为贵德乡。
1930年为第九区。
1932年划为第二区，区下设保联。
1938年废保联改为区、乡、保甲制，三都设乡为第一区管辖，1946年三都、西向合并恢复吉星乡。
1948年改三都乡。
1949年初为第四区人民政府三都、东山、理溪、合源、东浒等5个小乡，1950年改称三都区人民政府，1956年农业合作化撤区并乡，属三都乡，1958年人民公社化，三都、西乡合并为高峰公社，1959年5月两个公社分开，建立三都公社，1960年10月再次合并，次年分开，1968年冬扩社并队又合并，1970年10月再次分开，1984年撤社建乡，1995年6月撤乡建镇。