清属衣锦乡归荣里，1944年7月属第三指导区王坊乡，1947年改玉琊乡第六保属第五区王坊乡，1951年成立南冲乡属桑田区，1958年改建港口中、毛坞两大队属南冲公社，1964年并社隶南冲公社，1965年属南山采育林场，1968年与双丰合并称团结大队属南山公社，1970年改称港口大队，1972年分出双丰仍称港口大队，1984年改称港口村村民委员会属南山乡，2003年五梅山村村民委员会、黄泥村村民委员会并入仍称港口村村民委员会，名称沿用至今。