1949年前名赣县直属区水西乡第11保；1949年后名赣县水西区水西乡善边村；1950年属湖边区梨园乡；1958年9月属红旗公社湖边管理区梨园工区；1959年10月名善边大队，属湖边公社；1961年4月从赣县划属赣州市，名八0三公社善边大队；同年11月复归赣县，名湖边区湖边公社善边大队；1965年撤区，属湖边公社；1968年11月与刘家坊大队并入岗边大队；1972年10月分出，复名湖边公社善边大队；1978年元月随公社再从赣县划属赣州市；1984年4月公社改乡后，名湖边乡善边村。
1999年，撤地建市后，划归章贡区湖边乡。
2009年3月17日成立赣州市经开区后，委托经开区管理至今。