清朝初期为禁垦围场，清末至民国初年从外地陆续迁来农户垦荒种地，居住分散。
1931年“九一八”事变后，东北抗日联军活动于此地。
1935年，日伪并屯形成老屯等几个屯落。
1937年，日本“开拓团”强占此地，并以序号设居住点。
1946年解放后，归额穆区公益村管辖。
1948年8月，额穆县撤销，划归敦化县十区（额穆区）为青沟子村。
1956年成立青沟子乡政府，曾名东明乡。
1958年，成立青沟子人民公社。
1983年，撤社建乡为青沟子乡。