1988年底，惠农县增设马家湾镇，驻马家湾村。
1989年1月5日，划原庙台乡通丰村第五、七、八3个村民小组，设立惠农县马家湾镇马家湾村。
2003年7月22日，全县乡镇区划调整，由原来的马家湾镇、红果子镇、下营子乡合并组成了新的红果子镇，随之成立惠农县红果子镇马家湾村村民委员会。
2004年县区合并改为惠农区红果子镇马家湾村村民委员会。
2017年，村委会办公地点由消防队旁搬迁至庙台乡政府东侧原市场院内。