金、元以前，南湖境内的行政区划，无史料可考。
明代属安仁乡、观兰乡，清代属西乡、北乡，民国元年属沈疃区，1931年属第七区。
1945年9月，全县解放，首设南湖区，1947年7月，合并于沈疃区。
1950年5月，从沈疃区中撤出，称十三区，1956年1月称南湖区，辖15个乡。
1958年1月撤区，建南湖、下湖两个乡，同年8月成立先锋（南湖）人民公社和高锋（下湖）人民公社。
1963年恢复南湖区，下湖公社合并到南湖区，辖9处公社。
1971年3月分为南湖、下湖2个人民公社。
1980年1月-1995年5月更名为南湖乡，1995年5月南湖撤乡建镇，改名南湖镇，辖51个行政村；1980年1月，改下湖人民公社为下湖乡，辖31个乡镇村。
1987年5月，下湖乡驻地迁至尹家河村，改称尹家河乡；1995年5月，南湖乡撤乡建南湖镇。
2000年12月，尹家河乡合并到南湖镇。