明清时期南部除前后田平属崇文乡外，其余均属清渊乡；北部除万善乡前街为邱县飞地外，其余均为馆陶县地。
1937年前，南部属冠县第七区，万善前街仍属邱县飞地，其余为馆陶第一、七区。
建国初，西12村分属馆陶县第一、七区，其余为冠县第七区。
1958年，分属馆陶县北馆陶区、冠县城关区。
1965年，馆陶县漳卫河东岸的北馆陶区划入冠县后，分属北馆陶区、城关区。
1971年，撤区并社，由万善、王段2个小公社，合并成立万善公社。
1984年撤公社改乡，称万善乡至今。