仙河镇原名孤岛新镇。
1987年5月，中顾委委员林呼加来此视察时，见新镇被神仙沟与槐树林环保，碧水绿树，林水相映，似人间仙境，提议改名为仙河镇。
仙河镇地区系黄河泥沙淤积而成的新生陆地。
1960年后垦荒者、捕鱼者渐至；1963年中国人民解放军总后勤部来此牧马、造林；1970年胜利油田开始石油勘探；1972年成立胜利油田孤岛指挥部，在此开始大规模的开发建设；1983年指挥部聘请上海同济大学对仙河镇进行规划设计；1984年开始动工兴建；1987年孤东、孤岛两个指挥部合并为滨海指挥部，迁址仙河镇。
1992年山东省人民政府以（92）鲁政函字30号文批复，成立仙河镇人民政府，隶属东营市河口区。