该镇民国时期为惠民县第五区。
1948年全县辖区统改称谓，更名麻店区。
1950年全县辖区统一调整，复名第五区。
1955年9月全县辖区地名统改称谓，更名麻店区。
1956年12月麻店区分化为麻店、宋桥、店子三个乡。
1958年2月区划调整，麻店乡、宋桥乡（部分）、店子乡（部分）合并为麻店乡。
1958年11月建立人民公社时，麻店乡更名为麻店公社。
1961年麻店公社更名麻店区，下辖肖万、盐张、王店、五牌、麻店等5个公社。
1969年9月全县撤区改社，复名麻店公社。
1984年全县撤销人民公社建乡镇，麻店公社改建为麻店乡。
1995年12月麻店乡更名为麻店镇。