明时，属仁寿乡。
清光绪末年，改属九山区。
1930年，设为镇，属临朐县第八区。
1943年，设龙山区；1944年，划归九山区。
1952年，为第九区。
1956年，复为九山区。
1958年2月，分属呈子河乡、龙山乡、九山乡。
1958年9月，三乡合并成立九山公社。
1984年4月，析出沂山、白沙两乡后，余下58个自然村改设九山镇。
1991年11月，九子峪村划入沂山乡。
1992年3月，辛庄子、中山、耿家沟等划入沂山乡。
2001年2月，白沙、沂山两乡并入九山镇。