明时为咸宁县南乡韦曲里。
清代设韦曲镇。
中华民国元年（1912年）后，设韦曲区、镇、乡、联保。
1949年5月20日起，先后设韦曲区（辖10乡）、韦曲乡。
1954年，归长安县政府直属，辖9乡。
1958年，成立韦曲公社。
1961年，分设出申店、杜陵2公社。
1966年，改名红旗恩民公社。
1968年，改称红旗公社革命委员会。
1972年，复称韦曲公社。
1981年，改名韦曲公社管理委员会。
1984年，改设为镇，辖16生产大队。
2002年，将原申店乡和杜陵乡并入韦曲镇，辖46行政村、188村民小组、8社区。
2003年5月，撤镇设立韦曲街道。