清康熙十五年（1676年）设小水堡；清道光七年（1827年）原北乡大村名小水；民国初期，属进贤里设十甲六十村，其中有消水；民国三十八年（1949年）设保甲，属进贤乡七保消水堡；1949年至1950年，设消水乡隶属长武县二区管辖；1955年6月，长武县设相公区消水乡；1956年2月撤区并乡成为芋元乡消水村；1956年冬至1957年，成立互助组后转农业高级合作社，消水属四联高级农业社，其中包括消水、山坡、二坪、冯家岭；1958年12月，四联社撤销成立人民公社，消水生产大队设六个生产队，其中山坡为一队，二坪为二队，消水分为三队、四队、五队，冯家岭为六队；1961年后，设消水生产大队，设三个生产队，隶属芋元人民公社管辖；1968年，文化大革命时组建消水村革命委员会；1981年，实行大包干责任制后，分为4个生产队；1984年政社分设，健全乡村政权，成立消水村村民委员会，隶属芋元乡人民政府管辖。
2009年，二坪村并入消水村。
2011年，撤乡并镇，归芋元发展服务中心管辖。
2012年归相公镇芋元社区管辖。
2015年，冯家岭村并入消水村，同年，撤销芋元社区，归相公镇人民政府管辖。
2016年，柳沟村合并至消水村，归相公镇人民政府管辖至今。