解放前，1940年该地属椒溪镇第八保。
1948年，属椒溪乡第四保。
1949年12月8日佛坪县解放后，废除保甲制，实行区、乡、村制，属椒溪区（区公所设西岔河）西岔河乡。
1950年，属佛坪县第一区（区公所设西岔河）西岔河乡。
1952年属佛坪县第二区（区公所设西岔河）三教殿乡。
1956年属县直辖西岔河乡。
1958年9月15日，撤销区、乡、村制，建立人民公社，公社辖生产队，实行政社合一。
三教殿大队属三教殿公社。
1958年11月，三教殿大队随县制撤销划归洋县。
1961年9月佛坪县复设，属三教殿区（区公所设肖家庄）西岔河管理区。
1962年7月撤销区建制，改管理区为人民公社，属西岔河人民公社。
1967年西岔河人民公社更名为红星公社，属红星公社。
1976年，西岔河公社恢复原名。
1984年5月，人民公社更名为乡，大队改为村，三教殿村属西岔河乡管辖。
2009年9月撤乡改镇，三教殿村属西岔河镇至今。