潼关商代称桃林，隶定国。
周代称“渭汭”，为畿内地，隶北虢。
春秋时潼关称桃林塞，隶晋，晋守此防秦。
秦厉共公二十四年（前453）“晋地三分”后隶魏；秦惠文王六年（前332），魏献阴晋于秦，秦改阴晋名为宁秦置县，潼关属宁秦县辖地。
汉高祖五年（前202），在此设船司空衙门，专管黄、渭河水运、船库，之后以船司空官名为县名，隶京兆尹。
王莽新政元年（9），改船司空县为船利县，隶后承烈郡。
东汉时复名船司空县，隶司隶校尉部。
建安十八年（213），船司空县并入华阴，隶京兆尹。
后经三国、魏、晋275年均属华阴县。
北魏永熙三年（534）在今公庄村北设定城县，隶华州华山郡。
西魏时定城县并入敷西县，直至北周。
隋开皇三年(583)，属敷西县隶华州。
大业三年（607）改隶京兆郡，大业五年（609）改敷西县为华阴县，隶属潼关。
唐垂拱元年(685)，华阴名因避讳改称仙掌县，天授二年（691）分仙掌县东部设潼津县，隶虢卅；圣历二年（699）三月，改属太州（治所在今华县）。
长安二年（702）撤潼津县，并入仙掌县。
神龙二年（706）仙掌县复名华阴县，经五代、宋、金、元约670余年，潼关辖地均属华阴县管辖。
明洪武七年（1374）设潼关守御千户所，属陕西都司管辖。
两年后改设潼关卫，属河南都司管辖。
永乐六年（1408），属中军都督府辖。
清雍正二年（1724）撤潼关卫；五年（1727），设潼关县；乾隆十三年（1748）改设潼关厅，属陕西潼商道同州府辖。
1913年废厅，设潼关县，属陕西关中道。
1939年属陕西第八区行政督察专员公署（治所在大荔县）。
1947年属陕西第二区行政督察专员公署（治所在华县），直至解放。
1949午5月潼关解放，属渭南分区，1950年5月，属渭南专员公署。
1956年10月，渭南专员公署撤销后，直属陕西省直辖。
1958年12月，潼关、华阴、华县、渭南四县合并为渭南大县后，设潼关人民公社。
1961年8月，恢复潼关县制，属渭南专员公署（1979年改称渭南地区行政公署）。
1994年12月，渭南地区撤地设市，潼关县属渭南市管辖。
2015年乡镇改革后，辖城关、太要、秦东、桐峪、代字营5镇；屯丰、庆丰、顺丰、永丰塬、老虎城、欧家城、寺角营、十里铺、四知、鑫园、西姚、瀵兴、南头、东马、上善、三泰、留翎、中军帐18个村委会，南新、吴村中心、兴隆、太要、秦王寨、港口、代字营、桐峪、安乐10个社区。