汉时为潼亭。
民国三十三年（1944年）前，各村庄分属潼关、华阴、阌乡3县，政区无考。
同年，辖区有南刘、苏家、南街、凹里、十里铺、西北等属城关镇；西廒、金盆属桃林乡；寺角营、荒移、杨家庄属汉城乡；新城堡、四知、公庄、小泉属四知乡。
1951年，苏家、南刘、南街、十里铺、西北属第一区，公庄、四知、桃林寨、新城堡、小泉属第二区，金盆、西廒属第三区，寺角营、荒移、杨家庄属第四区。
1955年，撤区并乡后，各村分属城关镇、吊桥乡、十里铺乡。
1961年，恢复潼关县建制后，设港口公社，辖1个社区和11个生产队。
1984年，改为港口镇。
1994年8月，从港口镇中分出凹里、十里铺、西北，设桥头镇。
1995年7月，更名为秦东镇。
2002年1月，港口镇、秦东镇合并为秦东镇，人民政府驻原港口镇。
2010年8月，将高桥乡的新城堡、四知（吊桥）、公庄、桃林寨、小泉5个行政村划归秦东镇。