春秋时属晋。
战国时属秦。
秦属内史。
秦始皇二十六年（前221年)设商县，因商山得名，包括今商州区、丹凤县、商南县、山阳4县地。
西汉时东北部属弘农郡，其治所在弘农(今河南灵宝貌略镇北)，西南部属汉中郡，今柞水县西北部属京兆尹。
东汉大部属京兆尹，南部属南阳郡，西南部属汉中郡。
三国魏时，大部属京兆郡，今镇安县、柞水县西北部属魏兴郡。
晋泰始二年（266年）分京兆南部于上洛县（今商州区）置上洛郡，辖上洛、商县、丰阳3县。
北魏时属洛州，太延五年(439年)于上洛城置荆州；太和十一年(487年)又迁往襄阳，撤上洛郡，设洛州；太河十三年（489年）改置洛州，分设上洛郡、上庸郡、魏兴郡、苌和郡等5郡；景明元年（500年）分上洛郡地于商南县，置苌和郡；永平四年（511年）置上庸郡。
西魏大统三年（537年）增设拒阳郡。
北周保定元年（561年）撤销苌和郡、魏兴郡，设立慎政郡。
宣政元年（578年）洛州更名商州，领上洛郡、拒阳郡。
隋开皇三年（583年)撤上洛、上庸、拒阳、慎政四郡，大业三年(607年)废商州复设上洛郡。
唐武德元年(618年)废上洛郡复设商州，贞观元年(627年)划归山南道，开元二十五年(738年)归山南西道。
天宝元年(742年)再撤商州设上洛郡，乾元元年(758年)又撤上洛郡设商州，县治设上洛(今商州区)，领上洛县（今商州区）、商洛县（今丹凤县、商南县）、洛南县（今洛南县）、丰阳县（今山阳县）、乾元县（今镇安县及柞水县东南部）、上津县（今湖北省境内）。
北宋初属陕西路，后属永兴军路，领5县。
金属京兆府路，元光二年(1223年)改属河南路。
南宋属利州路。
元先属安西路，后属奉元路。
明属西安府，时称商州，辖今商州区、丹凤县，明洪武七年(1374年)降商州为商县。
成化十三年(1477年)复升为商州，领洛南、商南、山阳、镇安4县。
天启元年（1621年）为避名讳，改“洛”为“雒”。
清雍正三年(1725年)升为直隶州，直属陕西省，领商南、雒南、山阳、镇安4县。
1913年废州，商县（今商州区、丹凤县西南部）、雒南（今洛南及丹凤县东北部）、柞水（今柞水县西部及镇安县东北部）三县属关中道，山阳、商南、镇安三县属汉中道。
1928年废道属省。
1935年在商县城设第四行政督察区，辖商县、雒南、商南、山阳、镇安、柞水6县。
1949年5月设陕甘宁边区商雒分区，辖商县、雒南、商南、丹凤、山阳、镇安、柞水7县。
1950年5月，改设为商雒专区，仍辖7县。
1958年12月，撤销丹凤、柞水2县(丹凤县分属商南和商县，柞水与镇安县合并)，辖商县、洛南、商南、山阳、镇安5县。
1961年10月复设丹凤、柞水2县，辖7县。
1964年9月，因“雒”字生僻，改“雒”为“洛”，名商洛专区，辖7县。
1969年，改为商洛地区，辖7县。
1988年6月改商县为商州市（县级）。
2001年8月撤销商洛地区，设立地级商洛市；原县级商州市改设商州区；共辖1区6县。