明成化年间（1465年～1487年）复立三水县时，全县设有5镇16里。
湫坡头分属椒村里、北宫里。
清代，椒村里辖今湫坡头下部塬区及底庙各村；北宫里辖今湫坡头上部塬区及职田以下部分地区。
民国初，全县划为中、东、南、北、西5区，湫坡头乡隶属北区。
民国二十四年（1935年），建立革命根据地。
湫坡头区隶属新正县，为第四区，区公署驻湫坡头村。
下设第一乡（看花宫）、第二乡（坪坊）、第三乡（北崖头）、第四乡（椒村）、第五乡（甘家店）。
民国二十五年（1936年），推行保甲制。
北区划为太峪、底庙、太平3联保。
联保下设保，保下设甲。
联保设主任，保、甲置保、甲长。
看花宫、散集属职田联保3保，保公所设在看花宫。
其他各村属太平联保。
1950年，店子区辖看花宫、坪坊、椒村、甘家店等4乡，区公署驻甘家店村。
1956年，撤区并乡，店子区合并为两个乡，上片为湫坡头乡、下片为甘家店乡。
1958年，人民公社化时，湫坡头乡、甘家店乡合并设立和平人民公社。
机关驻地湫坡头村。
1959年，栒邑县并入彬县，和平人民公社并入职田人民公社。
后设置湫坡头管理区。
1961年，栒邑县制恢复后，设立湫坡头人民公社。
1984年6月，政社分设时，设立湫坡头乡人民政府。
1998年2月，更名湫坡头镇人民政府。