1958年8月，第三次区划调整，撤销杜寨乡，设立杨陵乡。
元树、崔西沟、崔东沟、马家底4个自然村组建元树生产大队，隶属于杨陵乡；10月，隶属于杨陵（红旗）人民公社；12月，武功县并入兴平县，元树生产大队隶属于兴平县杨陵人民公社。
1959年3月，兴平县杨陵人民公社下设杨村等4个管理区，元树生产大队隶属于杨村管理区。
1961年9月，第四次区划调整，复设武功县，武功县撤销杨村管理区，设立武功县杨陵人民公社，元树生产大队隶属于武功县杨陵人民公社。
1982年2月，陕西省设立宝鸡市杨陵区，元树生产大队隶属于宝鸡市杨陵区杨陵人民公社。
1983年10月，杨陵区划归咸阳市管辖，元树生产大队隶属于咸阳市杨陵区杨陵人民公社。
1984年3月，国家行政区划体制改革，人民公社称谓改“乡”，生产大队称谓改“村”。
杨陵区撤销杨陵人民公社，设立杨村乡，元树生产大队析为元树、崔西沟、崔东沟、马家底4个行政村，元树村、崔西沟村隶属于杨村乡。
2011年6月，杨陵区撤销杨村乡，元树村、崔西沟村隶属于杨陵街道。
2015年3月，杨陵区镇村行政区划调整，元树村、崔西沟村合并为元树村，隶属于杨陵街道。