1935年该村为九区区公所驻地；1949年为东二区驻地；1950年为一区湫峪沟乡驻地；1952年恢复湫峪沟区；1956年撤销湫峪沟区改为湫峪沟乡属杨家园则区；1958年为东风公社驻地；1961年为湫峪沟公社驻地；1965年湫峪沟公社并入史家畔公社。
1958年，人民公社实行政社合一，成立湫峪沟大队，因大队部驻地湫峪沟村而得名；1984年，改变“政社合一”体制，公社改为乡（镇），设立乡政权，乡下为村，设村民委员会，村下设村民小组，湫峪沟大队改名为湫峪沟村民委员会。
2014年12月26日，湫峪沟村委会、杨家沟村委会合并为湫峪沟村委会。