明清时期实行都里制，属五龙乡牛女都，下五里有三村：申家庄、贾村、北董。
民国，在明清四乡（太平、五龙、雄山、八谏）基础上实行编村制，也称区村镇制，属县二区（驻地苏店）。
南庄编村为主村，东申家庄为附村，也称联合村。
1949年，沿用区、村、镇制。
1953年，撤区设乡，实行乡村制，属县二区（驻地苏店）申家庄乡，下辖东申家庄、西申家庄、郝店三村。
至1956年，农村进行社会主义改造，组成联盟高级合作社，简称“联盟社”。
1958年，开始人民公社化，属苏店卫星人民公社苏店管理区。
1961年，卫星人民公社缩划，实行社队制，属苏店公社，置东申家庄生产大队，下辖4个生产小队。
1984年，改公社为乡（镇）政府，属苏店镇，东申家庄大队随改为东申家庄村民委员会，下辖2个村民小组。
2000年撤乡并镇，现属苏店镇。
截止2016年底，村政区划沿革未变。