1949年，属浮山县第四区，设为五十亩垣初级合作社。
1957年，属郭店人民公社，设为五十亩垣高级合作社。
1959年，属北韩人民公社，设为五十亩垣生产大队。
1961年，属郭店人民公社，为五十亩垣生产大队。
1963年属北韩人民公社，为五十亩垣生产大队。
1971年，属古县郭店人民公社，为五十亩垣生产大队。
1984年10月，撤销郭店人民公社，设立五十亩垣村民委员会。
2001年4月，将郭店乡、店上乡、茶坊乡合并为南垣乡，属南垣乡管辖。
2020年1月，五十亩垣村、刘垣村合并为五十亩垣村村民委员会，现属南垣乡管辖。