1971年娄烦建县时称孔河沟大队，归天池店公社管辖，下辖孔河沟、石窑湾、杏树坡三个自然村。
1981年3月杏树坡单独设立大队，孔河沟大队下辖孔河沟、石窑湾两个自然村。
1984年天池店公社改称为天池店乡，同时孔河沟大队更名为孔河沟村民委员会。
2001年撤乡并镇后仍为孔河沟村民委员会，同时撤销杏树坡村民委员会，杏树坡变更为自然村。
孔河沟村民委员会下辖孔河沟、杏树坡2个自然村。
2020年合并行政村后仍为孔河沟村民委员会。