庄底村建年不详，相传在唐宋年间、或更早些；清代实行乡约制，全县分32约，辖556个自然村，当时庄底属韩北约管辖，清宣统元年变里甲制，全县分10里、106甲，庄底属韩北里管辖，到1916年，实行区村制，全县划分为三个行政区，84个编村，庄底属二区（洪水）下辖的上合编村管辖，1949年属二区（蟠龙）下辖的一个自然村；1956年属柳沟乡柳沟农业生产合作社下辖的一个自然村；1958年属窑上沟乡王家圪道农业生产合作社下辖的一个自然村；1959年属韩北人民公社下辖的一个自然村；1961年属蟠龙人民公社下辖的一个自然村；1972年属蟠龙人民公社下辖的一个生产大队；1984年属蟠龙镇下辖的一个村民委员会；至今。