清顺治年间为南董，属太平县管辖。
民国3年（1914年），国民政府改太平县为汾城县，属汾城县管辖。
1954年9月，两县合并，归襄汾县管辖。
1958年10月人民公社化，撤销乡建制，实行政社合一。
隶属红旗公社。
1959年1月，襄汾县撤销，属侯马市管辖。
1961年7月恢复襄汾县建制，隶属襄汾县管辖。
几经变更，到1979年底为南董大队，归永固公社管辖。
1984年2月改行乡镇制，改称为南董村民委员会，隶属永固乡管辖。
2019年12月仁佑村并入南董村，隶属永固乡管辖至今。