1958年8月，我国全面开展人民公社化运动；同年9月，设立燕飞生产大队管理委员会，简称燕飞生产大队、燕飞大队。
1968年9月，更名为燕飞大队革命委员会。
1981年6月，复名燕飞生产大队管理委员会。
1984年4月，我国实行政社分设，撤销燕飞生产大队管理委员会，设立燕飞村村民委员会，简称燕飞村村委会。
1993年以前归达县地区巴中县管辖，1993年7月5日，设立巴中地区，巴中撤县建市，属巴中市恩阳镇管辖，2000年6月14日，设巴州区，属巴中市巴州区恩阳镇管辖，2013年1月18日，设恩阳区，属巴中市恩阳区恩阳镇管辖，2014年12月18日，区划调整，由原恩阳镇划归登科街道管辖。
2015年，将燕飞村第3、4、5、6村民小组和7村民小组的一部分合计5个村民小组划出成立盘兴村村民委员会，属巴中市巴州区回风街道管辖。
现燕飞村由第1、2、8村民小组和7村民小组的一部分合计4个村民小组组成。
2017年10月，燕飞村改为燕飞社区。