1958年8月，我国全面开展人民公社化运动；同年9月，设立三元生产大队管理委员会，简称三元管委会，又称五大队。
1968年9月，更名为三元大队革命委员会。
1981年6月，复名三元生产大队管理委员会。
1984年4月，我国实行政社分设，撤销三元生产大队管理委员会，设立三元村村民委员会，简称三元村村委会。
1993年以前归达县地区巴中县管辖，1993年7月5日，设立巴中地区，巴中撤县建市，属巴中市玉山镇管辖。
1998年元月，恢复金山乡，属巴中市金山乡管辖。
2000年6月14日，设巴州区，属巴中市巴州区金山乡管辖。
2005年3月，区划调整，属巴中市巴州区玉山镇管辖。
2013年1月18日，设恩阳区，属巴中市恩阳区玉山镇管辖，沿用至今。