清宣统二年（1910）元坝镇辖；1935年5月后分属漓江（岳漓）、东石、龙王三乡；1951年为跃进大队，属土鲤乡；1958年政社合一，更名为跃进大队，属土鲤人民公社；1981年地名普查重名改为琴溪大队；1984年政社分设，更名为琴溪村，属土鲤乡；1992年撤乡并镇，土鲤乡、漓江乡合并建立漓江镇，属漓江镇；1994年恢复乡镇建制复置土鲤乡，属土鲤乡；2005年乡镇建制调整，土鲤乡并入漓江镇，属漓江镇。
2020年乡镇村级建制调整同意琴溪村和寺基坪村合并，村名称；琴溪村村民委员会。