原属富顺县所辖。
清同治年间已形成场镇，名新店铺。
1951年，分别建立罗井、高峰、新店3乡，隶属何市区。
1955年，3乡合并为新店乡，同时划入瓦市区卫家乡一、二村及三村一部分。
1956年第三、四区合并后属牛佛区。
1958年，新店乡与仁和乡合并，成立新店公社。
1962年，将原仁和乡所属划归牛佛区，仍称新店公社，隶属何市区。
1978年4月，由富顺县划入大安区。
1995年8月，撤新店乡，设立新店镇属大安区管辖，名称沿用至今。